Memorial Day

En juin 1987, le colonel Myers retourna à la base aérienne de Langley. Sa première affectation, parmi les cinq qu'il y effectuera, fut celle de commandant de la 1re escadre de chasse tactique, chargée de la supériorité aérienne et principalement axée sur la région du Golfe persique. Après avoir achevé cette mission en février 1989, il fut muté au quartier général du Commandement aérien tactique. Il y occupa successivement les fonctions de chef d'état-major adjoint chargé de la planification jusqu'en juin 1989, d'inspecteur général jusqu'en janvier 1990, de chef d'état-major adjoint chargé de la planification jusqu'en juin 1990, et de chef d'état-major adjoint chargé des besoins jusqu'en décembre 1991. Ces affectations successives lui permirent de se familiariser parfaitement avec les besoins opérationnels et les programmes de modernisation, tels que le système radar de surveillance et d'attaque de cibles interarmées qui allait propulser l'Armée de l'air dans le XXIe siècle. Le 1er avril 1990, Myers reçut sa première étoile.

En septembre 1999, le président William J. Clinton nomma le général Myers au poste de cinquième vice-président des chefs d'état-major interarmées. La commission des forces armées du Sénat confirma sa nomination et, le 1er mars 2000, il rejoignit au Pentagone le chef d'état-major interarmées, le général Henry H. Shelton, et le secrétaire à la Défense, William S. Cohen. En tant que deuxième plus haut gradé des forces armées, le général Myers était membre à part entière des chefs d'état-major interarmées et présida les réunions de ce groupe en l'absence du général Shelton.

Le général Myers, alors qu'il assurait l'intérim de la présidence le 11 septembre 2001, a participé à la réponse immédiate aux attentats du 11 septembre et a aidé le général Shelton à élaborer une stratégie visant à vaincre, perturber et retarder le terrorisme dans le monde entier – la guerre mondiale contre le terrorisme – ainsi qu'à éradiquer les forces d'Al-Qaïda et des talibans en Afghanistan.

Nommé par le président Bush au poste de 15e chef d'état-major interarmées, le général Myers acheva sa confirmation dans le contexte tumultueux de l'après-11 septembre et prêta serment le 1er octobre 2001, devenant ainsi le premier vice-président à succéder à son prédécesseur. Il s'est fixé trois priorités : poursuivre la guerre mondiale contre le terrorisme, mener à bien la transformation des forces armées et soutenir le personnel militaire et leurs familles. En tant que principal conseiller militaire du président, du Conseil de sécurité nationale et du secrétaire à la Défense, il s'appuyait sur l'avis des chefs d'état-major interarmées en matière de sécurité nationale et favorisait un climat de collaboration propice à la recherche de consensus.

Le général Myers a pris sa retraite militaire le 30 septembre 2005, après plus de 40 ans de service actif. En reconnaissance de sa contribution, notamment de plus de six cents heures de vol de combat pendant la guerre du Vietnam, il a reçu la Médaille présidentielle de la Liberté le 9 novembre 2005. 

Depuis sa retraite de l'armée, le général Myers a siégé à plusieurs conseils d'administration d'organismes publics et à but non lucratif, et a également occupé la chaire Colin Powell de leadership, d'éthique et de caractère en matière de sécurité nationale à l'Université de la défense nationale. De 2016 à février 2022, il a été président de l'Université d'État du Kansas.